وظایف و اختیاراتی که برای دادستان یا قاضی اجرای احکام دادسرای عمومی و انقلاب مقرر شده است، در مورد موسسه های کیفری نظامی بر عهده دادستان نظامی یا قاضی اجرای احکام دادسرای نظامی است.
تبصره - منظور از نظامی، افراد مصرح در بندهای «الف» تا «ح» ماده 1 قانون مجازات جرایم نیروهای مسلح مصوب 1382 است.
بخش ششم - متهمان و محکومان دادسراها و دادگاه های نظامی
از
آیین نامه اجرایی سازمان زندان ها و اقدامات تامینی و تربیتی کشور
متهم و محکوم نظامی با رعایت مقررات اجرایی سازمان در موسسه های کیفری، جدای از دیگر زندانیان نگهداری می‌شوند.
در مراکز استان هایی که فاقد موسسه های کیفری نظامی هستند و یا ظرفیت پذیرش مناسب و کافی ندارند، متهمان و محکومان در بند اختصاصی نظامیان و جدای از دیگر زندانیان نگهداری می‌شوند.
محکومان غیر نظامی دادگاههای نظامی جهت تحمل محکومیت حبس به موسسه های کیفری عمومی معرفی می‌شوند.
افرادی که محکومیت حبس آنان به اخراج از خدمت منجر شود یا به تبع احکام دادگاه‌ها و یا تصمیم کمیسیونهای داخلی نیروهای مسلح جمهوری اسلامی ایران از خدمت اخراج شوند، به دستور قاضی اجرای احکام دادسرای نظامی برای تحمل کیفر حبس به موسسه عمومی معرفی می‌شوند.
متهمان و محکومان بر اساس جنس، نوع عضویت شامل پایور و وظیفه، درجه و رتبه شامل کارمند، درجهدار و افسر تا حد امکان سابقه، نوع جرم، شخصیت و میزان محکومیت، تفکیک و طبقه بندی می‌شوند.
برنامه های اصلاحی و تربیتی در موسسه های کیفری ویژه نظامیان علاوه بر برنامه های عمومی، شامل برنامه های آموزشی نظری در جهت بالا بردن توان رزمی و روحیه سربازی و دانش نظامی متهمان و محکومان نیز می‌باشد. یگانهای نظامی و انتظامی در اجرای برنامه های آموزشی با موسسه مربوط همکاری می کنند.
در صورت ضرورت مداوای متهمان و محکومان نظامی در مراکز درمانی خارج از موسسه، اولویت با مراکز درمانی نظامی و انتظامی است. این مراکز مکلف به درمان رایگان افراد معرفی شده می‌باشند.
محصلان مراکز نظامی و انتظامی با کمتر از هجده سال سن که مشمول قانون استخدام نیروهای مسلح جمهوری اسلامی ایران هستند، در صورت داشتن قرار منجر به بازداشت یا حکم محکومیت، در کانون اصلاح و تربیت نگهداری می‌شوند.
متهمان و محکومان نظامی دیگر مراجع قضایی که به موسسه منتقل می‌شوند، تابع مقررات این فصل هستند.
نحوه نگهداری متهمان و محکومان دادسراها و دادگاههای نظامی به موجب مواد این فصل است. در موارد سکوت، مطابق دیگر مقررات این آیین نامه اقدام می‌شود.