منابع مالی بنیاد عبارتند از:1- کمکهای مقام معظم رهبری.2- کمکها و اعتبارات مصوب در بودجه عمومی کشور.3- درآمدهای حاصل از فعالیتهای اقتصادی بنیاد.4- هدایا و کمکهای بنیاد مستضعفان و سایر اشخاص حقیقی و حقوقی.