از زمان لازم الاجراء شدن این قانون، قوانین و مقررات ذیل لغو می‌گردد:
الف - قانون امور گمرکی مصوب 1350/03/30 و اصلاحات و الحاقات بعدی آن
ب - آیین نامه اجرائی قانون امور گمرکی مصوب 1351/1/20 و اصلاحات و الحاقات بعدی آن
پ - لایحه قانونی راجع به محمولات سیاسی و لوازم شخصی متعلق به نمایندگان سیاسی ایرانی و خارجی مصوب 1359/3/28
ت - بندهای (1)، (2) و (3) ماده (2) و مواد (12)، (14) و (17) قانون مقررات صادرات و واردات مصوب 1372/7/4
ث - ماده واحده قانون یکسان سازی تشریفات ورود و خروج کالا و خدمات از کشور مصوب 1382/12/17
ج - ماده (41) قانون مالیات بر ارزش افزوده به استثنای تبصره های (1) و (3) آن مصوب 1387/2/17
چ - ماده (4) قانون گذرنامه مصوب 1351/12/10