شورای عالی انقلاب فرهنگی در جلسه 536 مورخ 1383/01/18، به پیشنهاد معاون اول رئیس جمهور (نامه شماره 9 مورخ 1383/01/05) ماده 6 اساسنامه صندوق حمایت از پژوهشگران کشور را به این شرح تصویب کرد:
ماده 6- صندوق دارای هیات امنایی متشکل از اعضای زیر است:
1- معاون اول رئیس جمهور (رئیس هیات امنا)
2- وزیر علوم، تحقیقات و فناوری
3- وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی
4- وزیر جهاد کشاورزی
5- وزیر صنعت، معدن و تجارت
6- رئیس سازمان مدیریت و برنامهریزی کشور
7- شش نفر از اساتید و پژوهشگران برجسته به پیشنهاد رئیس صندوق و تایید رئیس هیات امنا با حکم رئیس جمهور
8- رئیس صندوق به عنوان عضو و دبیر هیات امنا.
رئیس جمهور و رئیس شورای عالی انقلاب فرهنگی - سید محمد خاتمی