رئیس دانشگاه آزاد اسلامی طی نامه مورخ 90/6/26 با اعلام اینکه اخیرا دیوان عدالت اداری به رغم اینکه چندین پرونده به نفع دانشگاه آزاد اسلامی در آن مرجع مطرح است از پذیرش دادخواست های این دانشگاه با این استدلال که دانشگاه آزاد موسسه عمومی بوده و طرح دعوای دولت علیه دولت در دیوان مفهومی ندارد امتناع مینماید، درخواست تجدیدنظر در مسئله مزبور را می کند. حسب نظر رئیس دیوان پس از بررسی نظر مشورتی به شرح ذیل اعلام گردید:
«دانشگاه آزاد اسلامی از موسسات عمومی غیردولتی محسوب میشود و این امر در ماده 5 اساسنامه اصلاحی دانشگاه آزاد اسلامی که نهایتا در تاریخ 89/1/24 به تصویب شورای عالی انقلاب فرهنگی رسیده نیز مورد تصریح قرار گرفته است. النهایه با توجه به اینکه مطابق ماده واحده قانون تفسیری مجلس شورای اسلامی، دیوان میتواند نسبت به شکایات مطروحه از سوی موسسات عمومی مذکور در «قانون فهرست نهادها و موسسات عمومی غیردولتی مصوب 73/4/21 اعمال رسیدگی و اتخاذ تصمیم قانونی نماید و دانشگاه آزاد اسلامی در زمره موسسات احصاء شده در آن قانون نیست بنابراین رسیدگی به شکایات دانشگاه آزاد اسلامی علیه مامورین و واحدهای دولتی در صلاحیت دیوان عدالت اداری قرار میگیرد ولیکن رسیدگی به شکایات علیه دانشگاه آزاد اسلامی در صلاحیت دیوان عدالت اداری نمیباشد.»